Repensez votre préparation d’échantillon en multiomique : Préserver, Extraire et Conserver avec le cryoPREPTM!
Les approches multiomiques sont de plus en plus plébiscitées pour caractériser les échantillons précieux d’une manière globale, afin de mieux comprendre les interactions à l’échelle moléculaire.
Nous avons interrogé le fameux Pr. Murphy sur les prérequis nécessaires à une bonne préparation d’échantillon et comprendre pourquoi cette étape est primordiale dans le but d’obtenir l’ensemble des informations disponibles. 

En quoi le cryoPREP peut-il aider une approche multiomique ?
L’idée est d’extraire à partir d’un échantillon unique l’ensemble des biomolécules présentes comme les acides nucléiques, les protéines ou les métabolites. Utiliser la même source permet d’établir simultanément le génotype et le phénotype et ainsi comprendre les mécanismes de régulation conduisant à une biologie intégrée. L’extraction de ces biomolécules est une étape cruciale qui doit assurer leur préservation pour ne pas perdre d’information précieuse. C’est à cette étape essentielle que le cryoPREP devient indispensable.

 

 

Quels types d’échantillons peuvent être traités sur le cryoPREP ? 
Tous types de tissus fixés ou frais ainsi que des petits organismes ayant un poids compris entre 15mg et 2g comme des biopsies, des levures, des bactéries, des os, des graines, des drosophiles ou encore des moustiques.
 
 
 

 

 

Pouvez-vous nous détailler « Préserver, Extraire et Conserver » ?
Avec le cryoPREP, les échantillons sont préservés car nous utilisons un contenant fermé, le tissueTUBETM, sans contamination possible. De plus, la cryopulvérisation de l’échantillon permet un maintien à très basse température de l’échantillon et donc une conservation optimale de toutes les biomolécules extraites. Ce procédé est rapide, reproductible et ne nécessite pas de tampon, pour une meilleure standardisation. Après cryopulvérisation, la poudre d’échantillon obtenue peut être conservée directement dans le tissueTUBETM pour du long terme, ou aliquotée pour réaliser les analyses souhaitées en utilisant le tampon adéquat.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Comment fonctionne cette technologie ?
La cryopulvérisation est un procédé rapide en 3 étapes qui est résumé dans cette figure : 
 

L’échantillon d’intérêt est collecté à l’intérieur du tissueTUBETM, un contenant fait de Kapton, matériau qui a la propriété d’absorber les chocs sans se casser même à de très basses températures. Le tissueTUBETM, contenant l’échantillon, est ensuite plongé dans de l’azote liquide qui bloque toute activité enzymatique et permet ainsi de préserver les biomolécules. 

 

Le tissueTUBETM est inséré dans le cryoPREP à l’intérieur duquel l’échantillon va pulvérisé par un marteau électrique avec des forces mécaniques contrôlées selon des intensités variables. Le procédé est ultra rapide, 20 ms, et évite donc la montée en température de l’échantillon.

 

La poudre obtenue peut alors être stockée ou transférée. Vous pouvez également regarder cette vidéo qui détaille en une minute le fonctionnement du cryoPREP.

 

 

 

Quelle est la différence avec le mortier ou le « bead beating » ?
Notre technologie produit une force reproductible sans intervention manuelle, source de variabilité. L’utilisation de consommables fermés à usage unique, les tissueTUBES, ne nécessite aucun lavage et évite ainsi toute contamination. Vos échantillons sont précieux et vous souhaitez en extraire un maximum d’informations possible. Le cryoPREP utilise votre échantillon entièrement sans perte inutile, dans un procédé de cryopulvérisation qui, en évitant une montée en température non contrôlée, préserve les biomolécules d’intérêt de la dégradation. Enfin, la possibilité de stocker la poudre obtenue directement à l’intérieur des tissueTUBES permet d’ajouter une étape de pause pour reprendre vos expériences en temps voulu.

 

 

C’est vraiment intéressant : qui sont les utilisateurs de votre technologie et où pouvons-nous avoir plus d’information ?
Du fait de sa versatilité le cryoPREP peut être utilisé pour des process standardisés dans les entreprises pharmaceutiques ou des sociétés de services type CRO. Il est aussi l’outil indispensable dans de nombreux instituts pour les chercheurs ayant des échantillons précieux et fragiles, que ce soit en épigénomique, génomique, protéomique ou métabolomique. Nous sommes d’ailleurs recommandés dans les protocoles issus du Clinical Proteomic Tumour Analysis Consortium (CPTAC) de l’institut américain du cancer (NCI). Le muséum d’histoire naturelle de Londres aussi utilise notre instrument pour la caractérisation de petits organismes.
Merci Professeur Murphy !
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